با استفاده از گزارش‌­های حاصل از فاز شناخت وضع موجود و تحليل الگوهای جاری مدیریت فرایند در سازمان، عوارض نهان (نظير عدم هم‌راستايی استراتژي‌­های خرد در واحدهای سازمانی با استراتژی­‌های کلان، عدم وجود يا تدوين فرايندهای مناسب کاری و عدم وجود يکپارچگی در سازمان در سطوح مختلف) و عوارض آشکار (نظير عدم وجود چشم‌انداز، ماموريت، هدف و استراتژی کلان) شناسايی و مدون می­‌شود.